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在培育环境选择上，密云睡莲苗适宜在温暖、密云同城光照充足且水质清洁的环境中生长。培育初期，可选用口径 20-30cm、密云本地深度 30-40cm 的花盆，盆底铺设 10-15cm 厚的塘泥，塘泥需提前暴晒消毒，避免携带病菌或虫卵；将睡莲苗放入花盆后，覆盖 5-8cm 厚的塘泥，轻轻压实，防止幼苗倒伏，随后加入清水，水位以刚好没过叶片底部为宜，避免水位过高导致叶片腐烂。培育过程中，需控制水温在 20-25℃，若环境温度较低，可搭建保温棚或使用加热棒调节水温，确保幼苗正常生长。
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在质量管控体系方面，密云睡莲种苗基地建立了全流程的质量管控机制，从育种材料选择到种苗出圃，每个环节都进行严格检测。在育种阶段，对育种材料进行基因检测，确保其遗传特性稳定；在繁殖阶段，定期对种苗进行病虫害检测，采用 PCR 检测、密云ELISA 检测等技术，检测是否携带病毒、密云当地细菌等病原体；在种苗出圃前，对种苗的形态指标（根系长度、密云叶片数量、密云当地芽点饱满度）、密云生理指标（叶绿素含量、密云本地根系活力）进行检测，只有符合质量标准的种苗才能出圃。同时，基地还建立了种苗追溯体系，为每一批种苗建立档案，记录种苗的品种、密云繁殖时间、密云本地检测结果、密云本地销售去向等信息，便于客户追溯种苗来源，保障客户权益。
在品种研发与提纯方面，密云睡莲种苗基地投入大量资源开展品种研发工作，拥有专业的育种实验室，配备先进的育种设备，如组培苗培育设备、密云基因检测设备等。育种团队通过杂交育种、密云诱变育种、密云附近组培快繁等技术手段，培育具有优良性状的新品种，例如培育出抗病虫害能力强、密云当地耐污染、密云附近观赏价值高的密云睡莲品种；同时，对现有品种进行提纯复壮，通过多代筛选，去除变异株、密云本地劣株，确保品种纯度不低于 95％，避免品种退化，维持种苗的优良遗传特性。此外，基地还会对培育出的新品种进行田间试验，观察其在不同气候、密云本地土壤、密云附近水质条件下的生长表现，筛选出适应性强的品种进行规模化繁殖
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